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Les bactéries intestinales évoluent pour s'adapter parfaitement à votre corps

Les bactéries intestinales évoluent pour s'adapter parfaitement à votre corps

Une nouvelle recherche publiée cette semaine montre comment les bactéries intestinales courantes évoluent et s'adaptent rapidement pour s'adapter à l'environnement unique de votre corps.

Des bactéries intestinales qui se font à la maison

Des chercheurs du MIT ont mené une vaste étude génomique et métagénomique sur une population visant à déterminer comment l'une des bactéries les plus courantes dans notre gros intestin, Bactéroïdes fragilis, change non seulement entre différentes populations géographiquement distinctes, mais même au niveau personnel. Leurs résultats surprenants montrent une bactérie capable de reconfigurer rapidement ses gènes pour s'adapter parfaitement à son nouvel environnement.

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"Les souches de B. fragilis qui se développent chez les humains ont été dans cet environnement semblable à un intestin pendant des millions d'années, donc l'idée que rencontrer l'intestin d'un nouvel hôte induirait un tas de nouvelles mutations adaptatives, et que ces commensaux évolueraient encore rapidement, nous a surpris. », déclare Eric Alm, professeur de génie biologique et codirecteur du Centre pour l'informatique et la thérapeutique du microbiome du MIT.

L'ampleur des changements était dramatique. Au moins seize gènes différents ont subi des changements évolutifs au sein de la personne, avec une majorité de ces changements optimisant l'absorption de fibres dans les cellules humaines et la biosynthèse de l'enveloppe cellulaire.

«Les espèces de Bacteroides aident à digérer les fibres complexes du gros intestin, qui proviennent de la nourriture que vous mangez, de sorte que leurs adaptations peuvent être liées au régime personnalisé», a déclaré Shijie Zhao, co-première auteur de l'article et membre d'Alm laboratoire.

L'alimentation n'est peut-être pas le seul facteur

Les choix alimentaires ne sont cependant pas susceptibles d’être le seul moteur des mutations. Ils doivent échapper à notre système immunitaire, tout comme les autres bactéries et dans un environnement compétitif, les mutations peuvent être leur moyen de rester discret.

"Ces mutations pourraient être responsables du changement de la façon dont B. fragilis interagit avec le système immunitaire", a déclaré Tami Lieberman, co-premier auteur et professeur adjoint au Département de génie civil et environnemental du MIT. "Alternativement, cela pourrait être une technique pour améliorer leur capacité à repousser les attaques d'autres membres du microbiome."

Encore plus intéressant a été la révélation qu'il y avait des mutations distinctes entre les métagénomes orientaux et occidentaux. Où les Occidentaux avaient un allèle spécifique fortement exprimé mais qui s'est avéré rare chez les personnes vivant en Chine.

"Ce n'est pas une chose effrayante - je pense que nous devons juste être conscients et réfléchis du fait que vous pouvez faire des tests approfondis dans un laboratoire", a déclaré Alm, "mais une fois qu'un commensal arrive et devient une vraie personne dans le dans le monde réel, il peut évoluer - son phénotype peut changer - et c'est quelque chose qui peut être difficile à prévoir.


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