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Le génome le plus «recodé» au monde révélé

Le génome le plus «recodé» au monde révélé

Les biologistes synthétiques ont créé le génome le plus «recodé» au monde. Jason Chin et ses collègues du Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology de Cambridge ont présenté leur percée dans la revue Nature.

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L'équipe dispose d'un échantillon d'Escherichia coli poussant dans son laboratoire et dont le génome est entièrement différent de celui des autres souches de la même bactérie. Alors qu'ont ils fait? Chaque organisme sur terre utilise le même système pour s'organiser.

Rendre la nature plus efficace

Les codons sont les combinaisons de trois lettres des ADN A, T, C et G qui spécifient les acides aminés en protéines. Chaque organisme que nous avons rencontré utilise les mêmes 64 codons dont ils disposent.

Par exemple, le codon GCA spécifie la sérine, AAG spécifie la lysine. Mais AGT signifie aussi sérine, tout comme AGC, TCT, TCC et TCG. Ainsi, à certains égards, la nature peut être considérée comme inefficace car elle pourrait en fait réduire et utiliser seulement 20 codons pour 20 acides aminés, plus un pour «stop».

Percée pour la biologie synthétique

Les recodeurs comme Chin font quelque chose comme ce streaming mais en supprimant les codons redondants et en leur attribuant de nouvelles fonctions. Dans un processus incroyablement laborieux, Chin et ses collègues ont remplacé chaque occurrence du codon sérine TCG par AGC, chaque TCA (également sérine) par AGT et chaque TAG (arrêt) par TAA, pour un total de 18214 remplacements.

Chin note qu'il existe plusieurs façons de faire cette princesse, mais quelle que soit la méthode, les bactéries doivent rester en vie. Il a pu trouver une méthode pour maintenir E. coli en vie malgré l’utilisation de seulement 59 codons plutôt que les 61 naturels pour fabriquer les 20 acides aminés, et deux codons plutôt que les trois de la nature pour dire stop.

Cette percée ouvrira les portes à de nouveaux types de recodage de génomes pour une utilisation dans la recherche ainsi que pour d'éventuelles applications médicales.


Voir la vidéo: DNA vs RNA Updated (Juillet 2021).